Dans la phase d’animation du site Natura 2000, les actions du document d’objectif sont mise en œuvre.
Plusieurs outils sont utilisés par les animatrices des sites Natura 2000 :
- Les contrats Natura 2000
- Les mesures agroenvironnementales et climatiques : MAEC
- La charte Natura 2000
- L’évaluation des Incidences Natura 2000
- Le dialogue territorial : concertation et réunion du COPIL
- Les études et les suivis scientifiques
